เอเจนต์ฟ็อกซ์ มัลเดอร์ (รับบทโดยเดวิด ดูคอฟนี่) และ เอเจนท์ ดาน่า สคัลลี่ (รับบทโดยจิลเลียน แอนเดอร์สัน) พบเงื่อนงำของ UFO ในต่างเมืองที่ถูกปกปิดจากรัฐบาลในท้องถิ่นและกรมอนามัยของโลกที่กักันเชื่อไวรัสที่สามารถแพร่กระจายไปยังชุมชน เมื่อพบผู้เสียชีวิตเพิ่มมากขึ้น ในระหว่างนั้น เอเจนท์ ดาน่า สคัลลี่ ก็พยายมตรัวจสอบเชื้อโรคที่เ็นต้นต่อของทุกสิ่งที่ทำให้เอเลี่ยนส์จำศีล ในระหว่างที่มัลเดอร์ต้องหลีกเลี่ยงการจับกุมของหน่วยงานต่างๆ