ขณะที่หน่วยงาน IMF อยู่บนเส้นบางๆ ที่จะถูกปิด แบรนด์ท (เจเรมี เรนเนอร์) นักวิเคราะห์ภาคสนามได้ขึ้นมาเป็นผู้ช่วย ผอ. IMF เพื่อทำสำนวนและอยู่พิจาราณาในศาลเพื่อหาทางออกหรือแก้ไขข้อผิดพลาดที่สายลับได้ก่อเอาไว้อย่างเสื่อมเสียรวมไปถึงเงินจำนวนมากและชื่อเสียงของรัฐบาลได้ถูกไถ่ถามจากกระทรวงการต่างประเทศที่อาจก่อให้เกิดสงคราม แบรนด์ท จึงถูกสั่งให้ติดตามตัว อีธาน ฮันท์ (ทอม ครูซ) เพื่อจับกุมและหยุดปฎิบัติการของเขาให้มาช่วยเหลือ IMF เป็นครั้งสุดท้าย แต่เขาก็ได้ข้อร้องให้ แบรนด์ท และทีมงาน IMF ที่รู้จักกันดีให้ร่วมปฎิบัติการอีกครั้ง